Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms