Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC112Q8NEF3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms