Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms