Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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