Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms