Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD3P84022 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD3P84022 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD3P84022 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD3P84022 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD3P84022 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD3P84022 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD3P84022 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD3P84022 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD3P84022 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD3P84022 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms