Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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