Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms