Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 DYNLL1-202ENST00000392508 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RAET1K-201ENST00000403651 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TMED5-204ENST00000479918 1296 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RBM22P13-201ENST00000569805 1244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TRAM2-AS1-202ENST00000605910 1053 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.41-201ENST00000614637 258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 CCL28-203ENST00000513525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 AL353622.1-201ENST00000604716 1945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 OR11G2-201ENST00000357366 1038 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 VN1R28P-201ENST00000452517 896 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATXN8OSP0DMR3 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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