Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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