Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms