Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms