Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms