Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXD4Q12950 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD4Q12950 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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