Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms