Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB4BP68371 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBB4BP68371 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TUBB4BP68371 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms