Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIRAP54198 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms