Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SNHG15-209ENST00000584686 541 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATRXP46100 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATRXP46100 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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