Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms