Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms