Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf16Q9BUW7 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf16Q9BUW7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf16Q9BUW7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf16Q9BUW7 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf16Q9BUW7 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf16Q9BUW7 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf16Q9BUW7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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