Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms