Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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