Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC84Q86UT8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms