Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PDCD1Q15116 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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