Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF4P18085 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF4P18085 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms