Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms