Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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C9orf172C9J069 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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