Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms