Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THUMPD2Q9BTF0 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms