Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TRAPPC6BQ86SZ2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TRAPPC6BQ86SZ2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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TRAPPC6BQ86SZ2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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