Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CAMK2BQ13554 RBMS3-207ENST00000445033 1120 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms