Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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