Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP1P29466 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1102 ms