Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms