Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms