Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms