Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms