Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFG3L2Q9Y4W6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms