Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F4

TOGARAM1, TOG array regulator of axonemal microtubules protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOGARAM1Q9Y4F4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOGARAM1Q9Y4F4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOGARAM1Q9Y4F4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOGARAM1Q9Y4F4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms