Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP11BQ9Y2G3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP11BQ9Y2G3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11BQ9Y2G3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11BQ9Y2G3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11BQ9Y2G3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11BQ9Y2G3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11BQ9Y2G3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11BQ9Y2G3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP11BQ9Y2G3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP11BQ9Y2G3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms