Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFR3BQ9Y2G0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms