Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF13BQ9Y275 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms