Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms