Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDZRN3Q9UPQ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN3Q9UPQ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN3Q9UPQ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms