Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FZD4Q9ULV1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms