Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA8BQ9ULN7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA8BQ9ULN7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA8BQ9ULN7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms