Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SHROOM4Q9ULL8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SHROOM4Q9ULL8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SHROOM4Q9ULL8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC43■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SHROOM4Q9ULL8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms