Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIMKLBQ9ULI2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMKLBQ9ULI2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLBQ9ULI2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms