Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
ZNF608Q9ULD9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
ZNF608Q9ULD9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
ZNF608Q9ULD9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms